Операции по предоставлению займа с точки зрения налогового кодекса не облагаются НДС.

Тем не менее, на основании п. 5 ст. 168 НК РФ при реализации товаров (работ, услуг), операции по реализации которых не подлежат налогообложению (освобождаются от налогообложения), а также при освобождении налогоплательщика в соответствии со статьей 145 настоящего Кодекса от исполнения обязанностей налогоплательщика расчетные документы, первичные учетные документы оформляются и счета-фактуры выставляются без выделения соответствующих сумм налога. При этом на указанных документах делается соответствующая надпись или ставится штамп \"Без налога (НДС)\".

Таким образом, счет-фактуру составлять на сумму процентов следует, что подтверждает в своем письме от 22.06.2010 №03-07-07/40 Минфин РФ.

С другой стороны, тем же Минфином в письме от 22.06.2010 №03-07-07/40 была высказана противоположная позиция. Основывается в ней ведомство на то, что операции по передаче и возврату заемщиком суммы займа вообще не являются объектом налогообложения по НДС (на основании п. 2 ст. 146 и пп. 1 п. 3 ст. 39 НК РФ).

Резюмируя вышеизложенное, мы рекомендуем выставлять счет-фактуру по данной операции, включать в книгу продаж и отражать в разделе 7 налоговой декларации по НДС.