Я думаю, нужно написать официальное письмо в налоговую инспекцию по месту регистрации обос.подразделения с указанием суммы и причины переплаты ЕСН (а сдавали ли Вы отчетность по ЕСН в эту налоговую инспекцию??)Сумму неправильно уплаченного налога можно попросить перечислить на Ваш расчетный счет, но лучше зачесть в счет уплаты другого налога этого же бюджета (имущество, прибыль, НДФЛ...-этот вариант налоговикам нравится больше)-это указывается в Вашем письме.

Порядок зачета или возврата излишне уплаченной суммы налога, сбора, а также пени определен статьей 78 Налогового кодекса Российской Федерации.
Согласно пункту 7 статьи 78 Кодекса сумма излишне уплаченного налога подлежит возврату по письменному заявлению налогоплательщика.
Следовательно, для осуществления возврата излишне уплаченной суммы единого социального налога необходимо письменно обратиться в налоговую инспекцию по месту нахождения организации с просьбой вернуть необходимую сумму на расчетный счет организации.
Возврат суммы излишне уплаченного налога производится за счет средств бюджета (внебюджетного фонда), в котором произошла переплата, в течение одного месяца со дня подачи заявлений о возврате.
При нарушении указанного срока на сумму излишне уплаченного налога, не возвращенную в установленный срок, начисляются проценты за каждый день нарушения срока возврата.
Вместе с тем необходимо учесть, что в соответствии с пунктом 7 статьи 78 Налогового кодекса Российской Федерации в случае наличия у налогоплательщика недоимки по уплате налогов и сборов или задолженности по пеням, начисленным тому же бюджету (внебюджетному фонду), возврат налогоплательщику излишне уплаченной суммы производится только после зачета указанной суммы в счет погашения недоимки (задолженности).